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污染原因芝棒污染的根本原因是竞争性杂菌入侵感染，芝棒大范围污染事件多发生在灵芝栽培老产区，其污染原因归纳起来主要有以下几个方面：栽培品种抗逆性减弱抗逆性减弱是品种种性退化的一个表现，这是芝棒污染的内因。菌种不合格主要表现为栽培种带有杂菌；菌龄过长，菌种老化，萌发力差，吃料慢，菌丝弱，接种后封面时间长；高温、变温培养的菌种，菌丝纤细无力，扩展缓慢。栽培季节安排不当一是芝棒制作及接种期安排过晚（如2月以后），如春季突遇高温天气，发菌棚内温度达到40弋以上,极易“烧菌”，菌丝生理活动受到限制并逐渐死亡，各种杂菌趁机感染。二是芝棒制作及接种期安排过早（如11月以前），接种期间气温高，杂菌活跃，菌棒易感染。芝场环境污染主要是上年度染杂菌袋和出过芝的老袋以及当年污染的菌袋在房前、屋后、马路边、芝场旁边晾晒，没有及时清理销毁，致使大量霉菌孢子在空气中飞扬，造成环境污染。
灵芝包括多孔菌科灵芝属真菌赤芝Ganodermalucidum（Leyss.exFr.）Karst.或紫芝G.sinenseZhao,XuetZhang,具有补气安神、止咳平喘等功效，主治虚劳、心悸、失眠、头晕、神疲乏力、久咳气喘、冠心病、矽肺、肿瘤⑵。我国是早认识和利用灵芝的，关于灵芝扶正固本、滋补强壮的作用历代的医药学专著均有记载，两千多年前的周朝，《列子?汤问》一书中就记载了“朽壤之上，有菌者芝……煮汤沸其味清芳，饮之明目、心静、肾坚、脑清，其宝物也J《神农本草经》记载了六种灵芝:赤芝、青芝、黄芝、白芝、黒芝和紫芝，《本草纲目》更是详细的记录了灵芝的种类、药性。灵芝功效不断得到验证，对灵芝的药理作用研究也已走向世界，如美国、日本、英国等先后开展了对灵芝的药理与临床的深入研究，《美国草药药典》也正式收载了灵芝，而该药典迄今只收录十来种中药材或天然药物，足以看出全球对灵芝类药材的重视。我国是世界上三大锻木（原木）灵芝产区之一（另有韩国、日本），产量占世界总产量的50%以上。浙江从1989年开始灵芝人工栽培试验并取得成功，1992年农民利用纯锻木仿生法大规模栽培灵芝，产业化经营至2007年，平均每年锻木投放量3000立方米（时达7000立方米），年产干灵芝150吨，占全国总量的四分之一。
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